W poniższych przypadkach nie jest zalecane wykonanie mikropigmentacji:
- ciąża
- hemofilia
- zażywanie niektórych leków (np. rozrzedzających krew takich jak aspiryna itp., sterydów)
- zaawansowana cukrzyca
- trądzik ropowiczy
- czynna opryszczka
- infekcja wirusowa, bakteryjna lub grzybicza
- nowotwory skóry
- skłonność do powstawania keloidów i kolagenozy
- świeże blizny
- przebyte choroby gałki ocznej
- tendencje do stanów zapalnych spojówki
- tendencje rodzinne do odwarstwienia siatkówki
- stany zapalne skóry (np. powiek lub spojówek)
- choroby siatkówki i rogówki oka
- łuszczyca
- stosowanie Roacutane lub innych pochodnych retinolu (Izotrietinoidy)
- choroby zakaźne (żółtaczka, AIDS)